ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยาที่มีฟลูออรีนและสารเคมีเกษตร เนื่องจากมีกลุ่มฟังก์ชันทั้งไนไตรล์และไตรฟลูออโรมอกซี สารประกอบนี้มีฐานยับยั้งอิเล็กตรอนที่ช่วยเพิ่มปฏิกิริยาในการแทนที่อะโรมาติกแบบนิวคลีโอฟิลิก ทำให้มีคุณค่าต่อการเตรียมโมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะอย่างยิ่งมีประโยชน์ในการพัฒนายาฆ่าหญ้าและยาฆ่าเชื้อรา ซึ่งกลุ่มไตรฟลูออโรมอกซีช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและการซึมผ่านเยื่อหุ้มเซลล์ นอกจากนี้ยังใช้เป็นบล็อกก่อสร้างในเคมียารักษาเพื่อออกแบบตัวยับยั้งคินาสและตัวแทนบำบัดอื่นๆ ที่มุ่งเป้าไปที่โรคอักเสบและความผิดปกติทางระบบประสาท