ใช้ในงานสังเคราะห์สารประกอบทางเคมีที่ต้องการหมู่ไอโอดีนเป็นตัวทำหน้าที่นำทางหรือเป็นหมู่ที่สามารถทำปฏิกิริยาต่อได้ โดยเฉพาะในงานพัฒนายาหรือสารเรืองแสง นิยมใช้เป็นตัวตั้งต้นในการสร้างสารอนุพันธ์ที่มีคุณสมบัติพิเศษ เช่น สารติดตามในงานวิจัยทางชีวเคมี หรือเป็นส่วนประกอบของสารตรวจจับในระบบภาพทางการแพทย์ เนื่องจากไอโอดีนมีน้ำหนักอะตอมสูง จึงช่วยเพิ่มความคมชัดในภาพเอ็กซเรย์หรือเทคนิคถ่ายภาพอื่น ๆ ที่อิงกับความหนาแน่นของรังสี นอกจากนี้ยังสามารถนำไปใช้ในปฏิกิริยากลอนคู่เพื่อสร้างสารประกอบอินทรีย์ซับซ้อนผ่านทางเคมีแบบพัลลาเดียมเร่งปฏิกิริยา