ใช้ในสังเคราะห์สารอินทรีย์ โดยเฉพาะในการสร้างสารประกอบอารมาติกที่มีหมู่เมธอกซีเป็นสารตั้งต้นในปฏิกิริยาแทนที่ของนิวคลีโอไฟล์ นิยมใช้ในขั้นตอนการสร้างสารเภสัชกรรมและสารชีวภาพที่ต้องการโครงสร้างเบนซีนที่มีการแทนที่ด้วยหมู่เมธอกซีสองตำแหน่ง ไอโอดีนทำหน้าที่เป็นหมู่นำทาง (directing group) และสามารถถูกแทนที่ได้ง่ายในปฏิกิริยาคอปเปอร์หรือแพลเลเดียมเป็นตัวเร่ง เช่น ปฏิกิริยา Heck หรือ Suzuki จึงเหมาะสำหรับการสร้างโครงสร้างที่ซับซ้อนในห้องปฏิบัติการวิจัย