ใช้หลักๆ เป็นสารตั้งต้นเฉพาะทางในงานสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการเตรียมยาที่มีฟลูออรีนและสารเคมีเกษตร โครงสร้างที่ไม่เหมือนใครซึ่งมีหมู่แทนที่ด้วยไอโอดีนและหมู่เพนตาฟลูออโรเอทิลในรูปแบบ cis ช่วยให้เกิดปฏิกิริยาการจับคู่ข้ามแบบเลือกสรรและการเปลี่ยนแปลงหมู่ฟังก์ชัน มีคุณค่าอย่างยิ่งในการพัฒนาโมเลกุลชีวภาพที่ใช้งานได้ โดยการแทนที่ด้วยฟลูออรีนช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึม ความชอบไขมัน และความสัมพันธ์ในการจับ สารนี้ยังใช้ในงานศึกษาการติดฉลากด้วยรังสีเนื่องจากมีไอโอดีน ทำให้สามารถติดตามในระบบชีวภาพเมื่อติดฉลากด้วยไอโซโทปรังสี เช่น I-125 หรือ I-131