ใช้ในงานวิจัยด้านเภสัชกรรมเป็นหลัก โดยทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ หมู่ไอโอดีนช่วยให้สามารถนำไปใช้ในการติดฉลากรังสีสำหรับการถ่ายภาพทางการแพทย์ เช่น การถ่ายภาพด้วยโพซิตรอนอิมเมจจิ้ง (PET) โดยสามารถแทนที่ด้วยไอโซโทปรังสีได้ มีศักยภาพในการพัฒนายับยั้งคินาส ซึ่งสำคัญในการรักษามะเร็งเนื่องจากควบคุมเส้นทางส่งสัญญาณในเซลล์ นอกจากนี้ยังมีการศึกษาการนำไปใช้ในการสร้างลิกานด์เลือกสรรสำหรับตัวรับทางระบบประสาท ทำให้เกี่ยวข้องกับการค้นพบยาสำหรับระบบประสาทส่วนกลาง โครงสร้างอินดาโซลที่มีเมทอกซีและไอโอดีนเหมาะสำหรับใช้ในเคมียารักษาเพื่อปรับปรุงประสิทธิภาพและความเลือกสรรในยาโมเลกุลเล็ก