อิโซธีแฟลวินมีบทบาทสำคัญในด้านสุขภาพและอุตสาหกรรมอาหาร เนื่องจากมีคุณสมบัติต้านอนุมูลอิสระสูง ช่วยลดความเสี่ยงของโรคเรื้อรัง เช่น โรคหัวใจและหลอดเลือด รวมถึงช่วยควบคุมระดับน้ำตาลในเลือด ทำให้มีศักยภาพในการนำไปใช้พัฒนาผลิตภัณฑ์เสริมอาหารเพื่อสุขภาพ นอกจากนี้ยังใช้เป็นสารกันเสียจากธรรมชาติในอุตสาหกรรมเครื่องดื่ม โดยเฉพาะชาและเครื่องดื่มที่เน้นสุขภาพ เนื่องจากช่วยยับยั้งการเกิดออกซิเดชันและคงความสดของผลิตภัณฑ์ได้นานขึ้น