ใช้ในงานวิจัยด้านเภสัชกรรมเป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะในกลุ่มที่มีเป้าหมายเกี่ยวข้องกับเอนไซม์หรือตัวรับในระบบส่งสัญญาณของเซลล์ นิยมใช้ในขั้นตอนการพัฒนายาที่ต้องการศึกษาโครงสร้าง-กิจกรรม (SAR) เนื่องจากโครงสร้างของอินดาโซลมีความเสถียรและสามารถปรับเปลี่ยนได้ง่ายเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพหรือลดผลข้างเคียง พบการนำไปใช้ในงานค้นคว้าเกี่ยวกับฤทธิ์ต้านการอักเสบ ฤทธิ์ต้านจุลชีพ หรือสารช่วยกระตุ้นการทำงานของระบบประสาท อย่างไรก็ตาม ยังจำกัดอยู่ในระดับห้องปฏิบัติการและไม่ใช่ผลิตภัณฑ์ทางการค้า