ใช้ในงานสังเคราะห์อินทรีย์เป็นสารกลางสำคัญในปฏิกิริยาการจับคู่ข้ามของซูซูกิ-มิยาอูระ (Suzuki-Miyaura cross-coupling reactions) ซึ่งช่วยในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนสำหรับการพัฒนายาและสารเคมีเกษตร แกนอินดอลของมันมีคุณค่าต่อการสร้างโมเลกุลชีวภาพ โดยเฉพาะในการสังเคราะห์อนุพันธ์ของทริปตามีนหรือทริปโตเฟน ใช้กันอย่างแพร่หลายในเคมียารักษาเพื่อสร้างโครงสร้างเฮเทอโรไซคลิกที่ซับซ้อนซึ่งมีศักยภาพในการออกฤทธิ์ต่อยารักษาโรคระบบประสาทส่วนกลางและยาต้านมะเร็ง นอกจากนี้ยังใช้ในวิทยาศาสตร์วัสดุสำหรับการสร้างเซมิคอนดักเตอร์อินทรีย์และสีย้อมเรืองแสง เนื่องจากธรรมชาติที่อุดมด้วยอิเล็กตรอนของอินดอล