ใช้เป็นสารตั้งต้นในกระบวนการสังเคราะห์ทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในการผลิตสารออกฤทธิ์ทางเภสัชกรรม (APIs) ที่เกี่ยวข้องกับหมู่พิเพอราซีนและอะนิลีน ใช้กันทั่วไปในการพัฒนายับยั้งคินาสและโมเลกุลชีวภาพอื่นๆ เนื่องจากสามารถทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานสำหรับสารประกอบเฮเทโรไซคลิกที่ซับซ้อน นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยเคมียาในการศึกษาความสัมพันธ์โครงสร้าง-กิจกรรม (SAR) โดยหมู่เมทิลพิเพอราซีนช่วยเพิ่มความละลายและความสามารถในการจับกับโปรตีนเป้าหมาย รูปแบบเกลือไดไฮโดรคลอไรด์ช่วยปรับปรุงความเสถียรและการจัดการในปฏิกิริยาสถานะของแข็ง