ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายาต้านการอักเสบและยาที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง หมู่ไตรฟลูโรมิทิลช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและลิโพฟิลิก ทำให้มีคุณค่าต่อการออกแบบยา นอกจากนี้ยังใช้ในเคมีเกษตรเพื่อสร้างสารกำจัดวัชพืชและสารกำจัดเชื้อรา เนื่องจากช่วยปรับปรุงการดูดซึมทางชีวภาพและความคงตัวในสิ่งแวดล้อม ใช้กันทั่วไปในงานวิจัยเพื่อสร้างโมเลกุลอินทรีย์ซับซ้อนผ่านปฏิกิริยาเอสเทอร์ification หรือ amidation