ใช้หลักๆ เป็นสารกลางในกระบวนการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมสำหรับการสร้างยาพื้นฐานซัลโฟนาไมด์ หมู่ซัลโฟนิลคลอไรด์ของมันทำปฏิกิริยากับเอมีนได้ง่ายเพื่อก่อตัวซัลโฟนาไมด์ ซึ่งเป็นโครงสร้างหลักในโมเลกุลชีวภาพหลายชนิด รวมถึงยาต้านจุลชีพและยาต้านการอักเสบ ตัวแทนเมทิลไทโอสามารถทำหน้าที่เป็นกลุ่มนำทางในปฏิกิริยาการแทนที่อะโรมาติกด้วยไฟฟ้าบวก หรือถูกปรับเปลี่ยนเพิ่มเติมเป็นไทโออีเทอร์ ซัลฟอกไซด์ หรือซัลโฟน ซึ่งขยายประโยชน์ใช้ในเส้นทางสังเคราะห์ นอกจากนี้ยังใช้ในการพัฒนาสารเคมีเกษตรและวัสดุฟังก์ชันนัล เนื่องจากความตอบสนองและความเสถียรในฐานะบล็อกก่อสร้าง