2-Methoxyanofinic acid ใช้หลักในการสังเคราะห์สารกลางทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในการพัฒนายาต้านการอักเสบที่ไม่ใช่สเตียรอยด์ (NSAIDs) โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถดัดแปลงได้อย่างมีประสิทธิภาพ ทำให้มีคุณค่าในการสร้างสารออกฤทธิ์ที่มี bioavailability ที่เพิ่มขึ้นและการออกฤทธิ์ที่เจาะจง นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยด้านเกษตรเคมีสำหรับการออกแบบสารกำจัดวัชพืชและสารควบคุมการเจริญเติบโตของพืช เนื่องจากสามารถอิทธิพลเส้นทางเมแทบอลิซึมในพืช นอกจากนี้ สารประกอบนี้ยังทำหน้าที่เป็นบล็อกก่อสร้างในงานสังเคราะห์อินทรีย์ สนับสนุนการก่อตัวของระบบเฮเทโรไซคลิกที่ซับซ้อนที่ใช้ในเคมียารักษาโรค

ใช้ในอุตสาหกรรมเคมีเป็นตัวกลางในการสังเคราะห์สารประกอบอินทรีย์ โดยเฉพาะในกระบวนการผลิตยาและสารที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ เช่น ยารักษาโรคอักเสบ หรือยาแก้ปวด เนื่องจากโครงสร้างที่มีหมู่เมธอกซีและหมู่คาร์บอกซิลิก ทำให้มีความสามารถในการทำปฏิกิริยากับสารอื่นได้หลากหลาย จึงนิยมใช้เป็นสารตั้งต้นในการสร้างสารอนุพันธ์ที่ต้องการคุณสมบัติเฉพาะด้าน เช่น ความคงตัวสูงขึ้น หรือการละลายน้ำดีขึ้น นอกจากนี้ยังสามารถนำไปใช้ในงานวิจัยด้านเคมีทางการแพทย์และการพัฒนายาใหม่ๆ