ใช้ในงานวิจัยด้านเภสัชกรรมเป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะสารที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลาง เช่น ยาต้านอาการซึมเศร้า หรือยาต้านจิตประสาท โครงสร้างที่มีพิเพอราซีนทำให้มีศักยภาพในการจับกับตัวรับสารสื่อประสาทหลายชนิด จึงนิยมนำมาใช้พัฒนายาใหม่ในห้องปฏิบัติการ นอกจากนี้ยังใช้เป็นตัวกลางในการสร้างสารประกอบเชิงซ้อนในงานเคมีอินทรีย์ โดยเฉพาะการสร้างลิแกนด์สำหรับสารประกอบโลหะทรานซิชันที่ใช้ในตัวเร่งปฏิกิริยาหรือวัสดุฟังก์ชันพิเศษ