ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์สารอินทรีย์ในฐานะพันธมิตรการจับคู่กรดบอโรนิกในปฏิกิริยาข้ามการจับคู่ซูซูกิ-มิยาอูระ ซึ่งช่วยให้เกิดการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอน กลุ่ม (2-เมท็อกซีเอท็อกซิ)เมทิลช่วยเพิ่มความละลายในตัวทำละลายขั้ว ทำให้ประสิทธิภาพปฏิกิริยาดีขึ้นในระบบตัวทำละลายน้ำหรือผสม นิยมใช้ในการเตรียมสารกลางทางเภสัชกรรมและสารประกอบอะโรมาติกที่ถูกฟังก์ชันนัไลซ์ รวมถึงงานวิจัยและพัฒนายาและวัสดุพิเศษ เช่น สารเรืองแสงหรือสารนำไฟฟ้า กลุ่มปกป้องเมท็อกซีเอท็อกซิเมทิลให้ความเสถียรระหว่างปฏิกิริยาและสามารถถูกนำออกภายใต้สภาวะกรดอ่อนเมื่อจำเป็น อนุญาตให้มีการแปลงแบบเลือกสรรในสังเคราะห์หลายขั้นตอน