ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์เภสัชภัณฑ์และสารเคมีเกษตร โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการพัฒนาสารออกฤทธิ์ที่มีฟลูออรีน หมู่โบรโมและฟลูออโรของมันช่วยให้เกิดปฏิกิริยาการจับคู่ข้ามแบบเลือกสรรได้ ทำให้มีคุณค่ากในการสร้างโครงสร้างอะโรมาติกที่ซับซ้อน มักใช้ในการเตรียมสารกำจัดวัชพืชและสารกำจัดเชื้อรา เนื่องจากอะตอมฟลูออรีนช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึม นอกจากนี้ยังใช้ในเคมีทางการแพทย์สำหรับการสร้างยาที่มุ่งเป้าไปที่ความผิดปกติของระบบประสาทส่วนกลางและการอักเสบ