ใช้เป็นตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนาส่วนประกอบยาที่มีฤทธิ์ (APIs) ที่ต้องการคุณสมบัติไซโคลโพรเพลและอะมีน โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถปรับเปลี่ยนอย่างเลือกสรรในการออกแบบยา เพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและการดูดซึมในร่างกาย ใช้กันทั่วไปในการเตรียมยาต้านไวรัสและยาปฏิชีวนะ เนื่องจากคุณสมบัติเภสัชจลนศาสตร์ที่ดีที่เกิดจากกลุ่มเมทอกซีไซโคลโพรเพล นอกจากนี้ยังใช้ในการสังเคราะห์สารเคมีเกษตรสำหรับสร้างยาฆ่าแมลงชนิดใหม่ที่มีประสิทธิภาพดีขึ้นและโปรไฟล์สิ่งแวดล้อมที่ดีขึ้น รูปแบบเกลือไฮโดรคลอไรด์ช่วยเพิ่มความละลายและการจัดการในระบบปฏิกิริยาน้ำ