ใช้เป็นตัวกลางในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมยา มีส่วนร่วมในปฏิกิริยาคัปปลิ้งซัลโฟนาเพื่อสร้างซัลโฟนาไมด์ ซึ่งเป็นโครงสร้างสำคัญในโมเลกุลชีวภาพต่างๆ และยาในขั้นพัฒนา ความสามารถในการทำปฏิกิริยากับอะมีนทำให้มีคุณค่าในการนำกลุ่ม pyridine-morpholine sulfonamide เข้าสู่สารประกอบขนาดใหญ่ ซึ่งมักสำรวจในการพัฒนายับยั้ง kinase และการวิจัยเคมียา เนื่องจากมีวงแหวน morpholine และ pyridine ช่วยเพิ่มความละลายและความสามารถในการจับกับโมเลกุลเป้าหมาย นิยมนำมาใช้ร่วมกับสารประกอบที่มีหมู่อะมิโนเพื่อสร้างซัลโฟนาไมด์ ซึ่งเป็นโครงสร้างสำคัญในสารหลายชนิดที่มีฤทธิ์ต้านจุลชีพ ต้านไวรัส หรือมีศักยภาพในการรักษาโรคเรื้อรัง เช่น เบาหวาน หรือโรคมะเร็ง นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยด้านเคมีเชิงสร้างสรรค์เพื่อพัฒนาโมเลกุลใหม่ที่ต้องการความจำเพาะสูงต่อเป้าหมายทางชีวภาพ มักจัดการภายใต้สภาวะไร้น้ำเนื่องจากกลุ่มซัลโฟนิลคลอไรด์อ่อนไหวต่อความชื้น