ใช้หลักในฐานะอนุพันธ์กรดอะมิโนที่ได้รับการป้องกันสำหรับการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสแข็ง กลุ่ม Fmoc ให้การป้องกันชั่วคราวสำหรับหมู่อะมิโน ช่วยให้สามารถทำปฏิกิริยาเลือกที่ตำแหน่งอื่นๆ ได้ กลุ่ม but-3-en-1-yl ช่วยให้สามารถปรับแต่งเพิ่มเติมผ่านปฏิกิริยา cross-metathesis หรือการคอนจูเกชัน ใช้ทั่วไปในการเตรียมอินเตอร์มีเดียทเปปไทด์ โดยเฉพาะในงานวิจัยและพัฒนายาเภสัชเพื่อเปปไทด์ชีวภาพที่มีฤทธิ์ เสถียรภายใต้สภาวะปฏิกิริยาหลากหลาย ทำให้เหมาะสำหรับโปรโตคอลการสังเคราะห์อัตโนมัติ โดยกลุ่ม Fmoc มีความเสถียรต่อสภาวะการสังเคราะห์แต่ถอดออกได้ง่ายภายใต้สภาวะเบสอ่อน เช่น การใช้เพอร์ไพเพอริดีน