ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์ในฐานะสารกลางที่ได้รับการป้องกัน โดยเฉพาะในการผลิตเปปไทด์ทางเภสัชกรรมที่ซึ่งวงแหวนอินโดลและหมู่อะมิโนต้องการการป้องกันแบบเลือกเพศ หมู่ Boc (tert-butoxycarbonyl) ช่วยรักษาความคงตัวของหมู่อะมีนอัลฟาในระหว่างปฏิกิริยาการจับคู่ ในขณะที่หมู่แอมไดด์ที่ปลาย C-terminus สามารถทำหน้าที่เป็นตัวเลียนแบบพันธะเปปไทด์หรือเป็นสารตั้งต้นสำหรับเปปไทด์ที่ดัดแปลงที่ปลาย C-terminal ใช้กันอย่างแพร่หลายในสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสตะกอนและในการพัฒนาเปปไทด์ชีวภาพที่มีความคงตัวทางเมแทบอลิซึมเพิ่มขึ้น นอกจากนี้ยังนำมาใช้ในงานวิจัยเพื่อศึกษาการโต้ตอบระหว่างรีเซพเตอร์และลิแกนด์ที่เกี่ยวข้องกับลำดับที่มีทริปโตเฟน