ใช้ในอุตสาหกรรมอาหารและเครื่องดื่มเพื่อลดความขมในน้ำผลไม้ตระกูลส้มโดยการย่อยสลายนาริงิน ซึ่งเป็นสารที่ทำให้มีรสขม การรักษาด้วยเอนไซม์นี้ช่วยปรับปรุงรสชาติและความน่าประทับใจ ทำให้ผลิตภัณฑ์จากส้มเป็นที่ยอมรับของผู้บริโภคมากขึ้น

ใช้ในกระบวนการผลิตไวน์และไวน์จากผลไม้เพื่อเพิ่มกลิ่นหอมและความชัดเจน

นอกจากนี้ นาริงิเนสยังถูกใช้ในอาหารเสริมเพื่อสนับสนุนการย่อยอาหารและปรับปรุงการดูดซึมทางชีวภาพของฟลาโวนอยด์บางชนิด

มีบทบาทในงานวิจัยและการประยุกต์ใช้ทางเภสัชกรรมที่ต้องการการกำจัดน้ำตาลจากฟลาโวนอยด์สำหรับการวิเคราะห์หรือเพิ่มกิจกรรมทางชีวภาพ รวมถึงการสกัดและแปรรูปสารฟลาโวนอยด์ที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ เช่น นาริงเจนิน ซึ่งมีคุณสมบัติต้านอนุมูลอิสระและต้านการอักเสบ