ใช้เป็นอนุพันธ์กรดอะมิโนที่ได้รับการป้องกันในกระบวนการสังเคราะห์เพปไทด์ ซึ่งช่วยให้สามารถทำปฏิกิริยาคัปปลิ้งแบบเลือกเฉพาะได้โดยไม่มีการรบกวนจากสายข้าง หมู่อะมีนที่ป้องกันด้วย Boc ช่วยให้ถอดการป้องกันได้อย่างควบคุมภายใต้สภาวะกรดอ่อน เช่น กรดไตรฟลูออโรอะซีติก (TFA) ทำให้ไม่กระทบต่อพันธะเปปไทด์หรือหมู่ฟังก์ชันอื่น ๆ ที่ไวต่อกรด และมีคุณค่าในกระบวนการประกอบเพปไทด์แบบขั้นตอนทั้งในเฟสของแข็งและเฟสของเหลว นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมสารประกอบทางชีวภาพที่ active รวมถึงสารตั้งต้นทางเภสัชกรรมและตัวยับยั้งเอนไซม์ ใช้อย่างแพร่หลายในงานวิจัยสำหรับการติดฉลาก (labeling) การเชื่อมต่อ (conjugation) และการสังเคราะห์โมเลกุลออร์แกนิกที่ซับซ้อนซึ่งต้องการกลยุทธ์การป้องกันแบบ orthogonal