ใช้เป็นสารตั้งต้นในกระบวนการสังเคราะห์ยาและสารเคมีละเอียด โดยเฉพาะในการพัฒนาส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) ที่ต้องการการป้องกันหมู่เอมีน หมู่เอมีนที่ป้องกันด้วย BOC ช่วยให้เกิดปฏิกิริยาเลือกเฉพาะในปฏิกิริยาหลายขั้นตอน ทำให้มีคุณค่าในการค้นคว้ายาและการสังเคราะห์อินทรีย์ มักใช้ในการเตรียมฮีเทอโรไซเคิลที่มีไนโตรเจนและเอมีนที่ถูกฟังก์ชันนัไลซ์ซึ่งนำไปใช้ในเคมียารักษาโรค นอกจากนี้ยังใช้ในการผลิตโพลิเมอร์พิเศษและสารเคมีเกษตรเนื่องจากโซ่คลอโรอัลคิลที่ทำปฏิกิริยาได้และความเสถียรภายใต้สภาวะการเกิดปฏิกิริยาต่างๆ เนื่องจากหมู่ BOC (tert-butoxycarbonyl) ทำหน้าที่เป็นหมู่ป้องกันไนโตรเจน ช่วยควบคุมการเกิดปฏิกิริยาเฉพาะจุดในโมเลกุล ทำให้สามารถสร้างโครงสร้างที่ซับซ้อนได้อย่างมีประสิทธิภาพ นอกจากนี้ หมู่คลอไรด์ที่ปลายโซ่สามารถทำปฏิกิริยากับสารประกอบอื่น เช่น นิวคลีโอไฟล์ เพื่อสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนหรือคาร์บอน-ฮีเทอโรอะตอม ซึ่งมีความสำคัญในสังเคราะห์สารชีวภาพและสารประกอบทางเภสัชกรรม