ใช้เป็นสารกลางในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะในการป้องกันหมู่อะมิโนระหว่างการเตรียมเปปไทด์ที่ซับซ้อน กลุ่ม tert-butoxycarbonyl (Boc) ของมันช่วยป้องกันปฏิกิริยาไม่พึงประสงค์โดยการบล็อกหน้าที่ของอะมีน ในขณะที่เอสเตอร์คลอโรเมทิลช่วยให้เกิดการเอสเทอร์ification ที่ควบคุมได้หรือปฏิกิริยาการจับคู่เพิ่มเติม ใช้กันทั่วไปในการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสแข็งและในการพัฒนายาเภสัชภัณฑ์ที่ต้องการการประกอบลำดับที่แม่นยำ นอกจากนี้ยังมีประโยชน์ในการเตรียมโปรดรักที่ขึ้นอยู่กับเปปไทด์และในการปรับเปลี่ยนความเสถียรและความสามารถในการละลายของเปปไทด์