ใช้เป็นสารเคมีสำหรับการป้องกัน (protecting group reagent) ในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะสำหรับการป้องกันหมู่เอมีโนเลือกเพศในปฏิกิริยาอินทรีย์เชิงซ้อน โครงสร้าง tert-butoxy carbamate ให้ความเสถียรภายใต้สภาวะปฏิกิริยาต่างๆ ขณะที่อนุญาตให้ถอดการป้องกันได้อย่างสะอาดภายใต้สภาวะกรดอ่อนๆ ใช้กันทั่วไปในการเตรียมสารกลางสำหรับเภสัชภัณฑ์ โดยเฉพาะในการพัฒนายับยั้งโปรติเอสและโมเลกุลชีวภาพอื่นๆ ส่วน cyclohexyl และ benzyl ช่วยเพิ่มความละลายและความเข้ากันได้ในตัวทำละลายอินทรีย์ ทำให้เหมาะสำหรับการสังเคราะห์แบบเฟสของแข็งและแบบสารละลาย ชื่นชอบเนื่องจากความบริสุทธิ์สูงและปฏิกิริยาไม่พึงประสงค์น้อยที่สุดในขั้นตอนการจับคู่