ใช้ในสังเคราะห์เปปไทด์เป็นบล็อกสร้างกรดอะมิโนที่ได้รับการป้องกัน โดยเฉพาะสำหรับการแนะนำหมู่อะลานีนที่ถูกไอโอไดน์เข้าไปในโซ่เปปไทด์ หมู่ Fmoc ช่วยให้สามารถสังเคราะห์แบบ solid-phase ภายใต้สภาวะเบสอ่อน ขณะที่อะตอมไอโอดีนทำหน้าที่เป็นจุดยึดสำหรับการปรับแต่งเพิ่มเติมผ่านปฏิกิริยา cross-coupling เช่น Suzuki หรือ Sonogashira ใช้กันทั่วไปในการพัฒนาเปปไทด์ที่ติดฉลากรังสี สารยับยั้งเอนไซม์ หรือโปรบสำหรับการศึกษา biochemical เอสเตอร์เมทิลป้องกันกรดคาร์บอกซิลิกในระหว่างการประกอบโซ่ และสามารถกำจัดออกได้อย่างเลือกเฉพาะภายใต้สภาวะเอสเทอโรไลติกหรือไฮโดรไลซิสอ่อนในภายหลังของการสังเคราะห์