ใช้หลักๆ เป็นสารกลางในกระบวนการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการเตรียมสารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพ ทำหน้าที่เป็นรูปแบบที่ป้องกันของกัวนิดีน ช่วยให้สามารถทำปฏิกิริยาเลือกที่ได้ที่ตำแหน่งฟังก์ชันอื่นๆ ในการประกอบโมเลกุลที่ซับซ้อน ใช้บ่อยในการพัฒนายา รวมถึงตัวยับยั้งโปรติเอสและยาที่มุ่งเป้าไปยังเอนไซม์อื่นๆ กลุ่มป้องกัน CBz (carbobenzyloxy) สามารถถอดออกได้ง่ายภายใต้สภาวะอ่อน ทำให้น่าใช้ในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์และกระบวนการเคมียารักษาโรค นอกจากนี้ยังใช้ในการสร้างอนุพันธ์อะจินีนและเครื่องมือวิจัยสำหรับไนตริกออกไซด์ซินเทส