ใช้ในงานวิจัยด้านชีวเคมีและการแพทย์ในฐานะอนุภาคเปปไทด์ฟอสโฟรีเลตแบบจำลอง โดยเฉพาะในการศึกษาที่เกี่ยวข้องกับเส้นทางการส่งสัญญาณ (signal transduction pathways) ดำเนินการเป็นซับสเตรตหรือตัวยับยั้งสำหรับเอนไซม์ เช่น คินาสและฟอสฟาทาส เนื่องจากมีกลุ่มฟอสโฟเนต ซึ่งเลียนแบบเอสเตอร์ฟอสเฟตในโปรตีน การปรับเปลี่ยนอะซิติลและอะไมด์ช่วยเพิ่มความเสถียรต่อการย่อยสลายโดยโปรติโอไลติก ทำให้เหมาะสำหรับการทดสอบในเซลล์ ใช้ในการพัฒนาโพรบสำหรับตรวจจับกิจกรรมเอนไซม์หรือปฏิสัมพันธ์โปรตีน-โปรตีน นอกจากนี้ยังนำไปใช้ในการออกแบบแอนติเจนสังเคราะห์และในการศึกษาความสัมพันธ์โครงสร้าง-กิจกรรม (SAR) ของเปปไทด์ที่มีไทโรซีน รูปแบบเกลือ TFA ช่วยปรับปรุงการละลายและการจัดการในระบบตัวทำละลายน้ำและอินทรีย์