ใช้เป็นบล็อกสร้าง dipeptide ที่ได้รับการป้องกันในการสังเคราะห์เปปไทด์ซับซ้อนและยาเภสัชภัณฑ์ การใช้งานหลักอยู่ในเคมีอินทรีย์และเคมียา โดยเฉพาะในการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสแข็งหรือเฟสละลายที่ต้องการการป้องกันหมู่เอมีโนเลือกเพศ กลุ่ม tert-butoxycarbonyl (Boc) ให้ความเสถียรภายใต้สภาวะปฏิกิริยาต่างๆ และสามารถถอดออกได้ภายใต้สภาวะกรดอ่อน ช่วยให้ประกอบสายเปปไทด์ทีละขั้นตอน เอสเตอร์เบนซิลป้องกันกรดคาร์บอกซิลิกปลาย C และสามารถตัดออกด้วย hydrogenolysis สารนี้มีค่ามากในการเตรียมยาที่มีฐานเปปไทด์ ตัวยับยั้งเอนไซม์ และโมเลกุลชีวภาพที่ใช้งานได้ซึ่งต้องการการควบคุมความแม่นยำเหนือ stereochemistry และ reactivity ของหมู่ฟังก์ชัน