ใช้ในการสังเคราะห์เปปไทด์ในฐานะอนุพันธ์กรดอะมิโนที่ได้รับการป้องกัน ซึ่งช่วยให้เกิดปฏิกิริยาการจับคู่แบบเลือกสรรโดยไม่เกิดการเกิดเรคเคมีเซชัน (racemization) หน้าที่ของหมู่เอสเตอร์และคาร์บาเมตช่วยรักษาเสถียรภาพของโครงสร้างในระหว่างการสังเคราะห์แบบเฟสของแข็งหรือเฟสละลาย ทำให้มีคุณค่าต่อการผลิตตัวกลางทางเภสัชกรรมและเปปไทด์ชีวภาพ นิยมใช้ในการพัฒนายับยั้งเอนไซม์และอนุพันธ์เมแทบอลิซึมเนื่องจากขนาด steric และคีรอลิตี (chirality) ของแกนวาลีน นอกจากนี้ยังทำหน้าที่เป็นบล็อกก่อสร้างคีรอลในการสังเคราะห์แบบอะซิมเมตริกสำหรับการค้นพบยา