ใช้เป็นสารกลางในการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการพัฒนายาที่มีโครงสร้างเบนโซไดออกโซลที่มีไนโตร หมู่คลอโรฟอร์เมตที่ทำปฏิกิริยาสูงช่วยให้เกิดปฏิกิริยาการจับคู่กับเอมีนหรือแอลกอฮอล์ ทำให้มีคุณค่าต่อการสร้างพันธะคาร์บอเนตหรือคาร์บาเมตในโมเลกุลชีวภาพที่ออกฤทธิ์ ใช้อย่างแพร่หลายในเคมีการแพทย์สำหรับการปรับแต่งผู้สมัครยาเพื่อเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมหรือความเข้มข้นในการจับมัด นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมโปรดรักและตัวยับยั้งเอนไซม์ เนื่องจากความสามารถในการปกปิดหมู่ฟังก์ชัน