ใช้ในสังเคราะห์เปปไทด์แบบแข็ง โดยเฉพาะในกระบวนการผลิตเปปไทด์ที่ต้องการความบริสุทธิ์สูง เนื่องจากหมู่ Fmoc ช่วยป้องกันหมู่อะมิโนในระหว่างการสร้างพันธะเปปไทด์ และสามารถถอดหมู่ป้องกันออกได้ง่ายภายใต้สภาวะเบสอ่อน ทำให้เหมาะสมกับการสังเคราะห์แบบขั้นตอนเดียว หมู่ฟลูออรีนที่ตำแหน่ง 2 ของวงเบนซีนช่วยเพิ่มความเสถียรและเปลี่ยนแปลงคุณสมบัติทางชีวภาพของเปปไทด์ เช่น เพิ่มความสามารถในการดูดซึมหรือความจำเพาะต่อเป้าหมายทางชีวภาพ นิยมใช้ในงานวิจัยด้านเภสัชกรรมและโปรตีนวิทยา โดยเฉพาะในการออกแบบเปปไทด์ที่มีฤทธิ์เฉพาะทางหรือใช้เป็นโมเลกุลต้นแบบสำหรับการพัฒนายา