ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์ในฐานะหน่วยย่อยอะมิโนที่ได้รับการป้องกัน ซึ่งช่วยให้เกิดปฏิกิริยาการจับคู่แบบเลือกเพศ ขณะที่ป้องกันปฏิกิริยาข้างเคียงที่ไม่ต้องการที่หมู่อะมีน หมู่ Fmoc ช่วยให้สามารถถอดการป้องกันด้วยฐานอ่อน ทำให้เข้ากันได้กับกลยุทธ์การสังเคราะห์แบบเฟสของแข็ง การแทนที่ด้วย N-ethyl สามารถมีอิทธิพลต่อการกำหนดรูปแบบและความเสถียรของเปปไทด์ มักใช้ในการพัฒนาเปปไทด์ชีวภาพและ peptidomimetics ใช้กันทั่วไปในการวิจัยเภสัชกรรมและการค้นพบยาสำหรับการสร้างลำดับเปปไทด์ที่ซับซ้อนด้วยความบริสุทธิ์สูง