โปรโตกราเซลลินถูกใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะในงานวิจัยด้านเภสัชกรรม ซึ่งช่วยในการพัฒนายาที่มีเป้าหมายไปยังระบบประสาทและสมอง มีการศึกษาว่าสารนี้สามารถข้ามเกราะเลือดและสมองได้ ทำให้มีศักยภาพในการรักษาโรคทางระบบประสาท เช่น อัลไซเมอร์ และพาร์กินสัน นอกจากนี้ยังถูกใช้ในห้องปฏิบัติการเพื่อศึกษาการส่งสัญญาณของเซลล์ประสาทและการสร้างโปรตีนที่เกี่ยวข้องกับการอักเสบในสมอง ด้วยคุณสมบัติในการปรับการทำงานของเอนไซม์บางชนิด ทำให้โปรโตกราเซลลินเป็นโมเลกุลสำคัญในงานวิจัยด้านชีวเคมีและนิวโรฟาร์มาซี