ใช้หลักๆ เป็นตัวประกอบพื้นฐานฟลูออรีนในกระบวนการสังเคราะห์สารอินทรีย์ โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมและเกษตรเคมี หน้าที่ของไอโอดีนช่วยให้เกิดปฏิกิริยาการจับคู่ เช่น การจับคู่ข้ามหรือปฏิกิริยารากอิสระ ซึ่งช่วยนำกลุ่มคล้ายเพนตาฟลูออโรโพรพิลเข้าไปในโมเลกุลเป้าหมาย สิ่งนี้ช่วยเพิ่มความชอบไขมันและความเสถียรทางเมแทบอลิซึมในสารประกอบชีวภาพ นอกจากนี้ยังใช้ในวิทยาศาสตร์วัสดุเพื่อปรับคุณสมบัติพื้นผิว เช่น เพิ่มความกลัวน้ำและความต้านทานสารเคมีในโพลิเมอร์และสารเคลือบพิเศษ ปริมาณฟลูออรีนที่เป็นเอกลักษณ์ทำให้มีคุณค่าต่อการพัฒนาตัวเร่งฟลูออรีนและสารติดตามร่องรอยสำหรับการประยุกต์ใช้ในการวิจัย