ใช้หลักๆ เป็นสาร derivatizing agent ในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการเตรียมสารประกอบซัลโฟนาไมด์ ความตอบสนองสูงต่อนิวคลีโอไฟล์ทำให้มีคุณค่าต่อการวิจัยเภสัชภัณฑ์ในการปรับเปลี่ยนเอมีนและแอลกอฮอล์ ใช้กันทั่วไปในการพัฒนายับยั้งโปรติเอสและโมเลกุลชีวภาพอื่นๆ เนื่องจากสามารถเพิ่ม lipophilicity และความเสถียรทางเมแทบอลิซึม นอกจากนี้ยังใช้ในการสังเคราะห์สารเกษตรเพื่อสร้างโครงสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อน โครงสร้างอะโรมาติกที่ใหญ่และอิเล็กตรอนรุ่มรวยช่วยให้เกิดการป้องกันเชิง steric ซึ่งสามารถมีอิทธิพลต่อความเลือกในปฏิกิริยา ใช้บ่อยในเคมีเปปไทด์เพื่อป้องกันหรือกระตุ้นหมู่ฟังก์ชันระหว่างการสังเคราะห์แบบขั้นตอน โดยเฉพาะในการ sulfonylation บนเอมีนหรือแอลกอฮอล์เพื่อสร้างซัลโฟนาไมด์หรือซัลโฟเนตเอสเทอร์ ซึ่งสำคัญในการพัฒนายาและสารชีวภาพ และสามารถใช้ป้องกันหมู่ -OH หรือ -NH ชั่วคราว เนื่องจากกลุ่มเพนตามีทิล-2,3-ไดไฮโดเบนโซฟูแรน-5-ซัลโฟนิล (PMBS) สามารถถอดออกได้ภายใต้สภาวะที่ควบคุม