ใช้เป็นตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการเตรียมสารประกอบทางเภสัชกรรม ฟังก์ชันอัลไคน์ของมันช่วยให้เกิดปฏิกิริยาเคมีคลิก ทำให้มีคุณค่าในการค้นพบยาและพัฒนาโมเลกุลชีวภาพที่ใช้งานได้ ใช้กันทั่วไปในการสังเคราะห์ตัวยับยั้งคินาสและตัวยารักษาอื่นๆ โดยที่วงแหวนมอร์โฟลีนช่วยเพิ่มความละลายและคุณสมบัติการจับมัด นอกจากนี้ยังใช้ในวิทยาศาสตร์วัสดุสำหรับการสร้างโพลิเมอร์ที่ฟังก์ชันนาไลซ์และลิกานด์สำหรับการเร่งปฏิกิริยา