ใช้ในงานวิจัยด้านฟลูออเรสเซนซ์ เนื่องจากพายเรนเป็นสารที่มีคุณสมบัติเรืองแสงได้ดีมาก จึงนิยมใช้ 1-Pyrenebutyryl Chloride เป็นตัวทำเครื่องหมาย (labeling agent) กับสารชีวโมเลกุล เช่น โปรตีน หรือกรดนิวคลีอิก เพื่อติดตามการเปลี่ยนแปลงหรือศึกษาพฤติกรรมของโมเลกุลเหล่านั้นในระบบชีวภาพ นิยมใช้ในงานวิเคราะห์การถ่ายโอนพลังงานเรืองแสง (FRET) เพราะพายเรนมีความสามารถในการดูดซับและปล่อยแสงที่ความยาวคลื่นเฉพาะ ทำให้เหมาะสำหรับการศึกษาปฏิสัมพันธ์ระหว่างโมเลกุล นอกจากนี้ยังใช้ในการสังเคราะห์โพลิเมอร์ที่มีคุณสมบัติเรืองแสง หรือวัสดุออปโตอิเล็กทรอนิกส์ เช่น เซนเซอร์ตรวจจับสารเคมี หรือวัสดุสำหรับอุปกรณ์แสดงผล