สาร bis-PEG2-endo-BCN ถูกใช้เป็นตัวเชื่อมในกระบวนการเคมีที่เรียกว่า click chemistry โดยเฉพาะในการจับคู่โมเลกุลผ่านปฏิกิริยา SPAAC (Strain-Promoted Alkyne-Azide Cycloaddition) ซึ่งไม่จำเป็นต้องใช้ทองแดงเป็นตัวเร่ง ทำให้เหมาะสำหรับการใช้งานในระบบชีวภาพที่ไวต่อพิษของโลหะ โครงสร้างที่มี PEG2 (polyethylene glycol) ช่วยเพิ่มความสามารถในการละลายน้ำ และลดการรวมตัวของโปรตีนหรือโมเลกุลชีวภาพ ขณะที่ส่วนของ endo-BCN ทำหน้าที่เป็นหมู่ตอบสนองที่จับกับหมู่แอซีดได้อย่างมีประสิทธิภาพและเฉพาะเจาะจง โดยทั่วไป สารนี้ถูกนำมาใช้ในการติดป้ายโมเลกุลชีวภาพ เช่น โปรตีน แอนติบอดี หรือกรดนิวคลีอิก เพื่อการถ่ายภาพทางชีวภาพ การส่งยาเฉพาะจุด หรือการพัฒนาเวกเตอร์ส่งยีน นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยด้านชีววัสดุและนาโนเวชภัณฑ์ที่ต้องการการควบคุมการจับตัวของโมเลกุลอย่างแม่นยำ