ใช้เป็นตัวสร้างพื้นฐานในสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการเตรียมเภสัชภัณฑ์และโมเลกุลชีวภาพ หมู่อัลไคน์ช่วยให้เข้าร่วมในปฏิกิริยาเคมีคลิก เช่น การ cycloaddition ระหว่างอะซายด์-อัลไคน์ที่ใช้ตัวเร่งทองแดง (CuAAC) ทำให้มีคุณค่าต่อการค้นพบยาและเคมีแบบรวมสาร หมู่อะมีนช่วยให้เกิดการจับคู่กับสารประกอบคาร์บอนิลหรืออนุพันธ์กรดคาร์บอกซิลิกได้ง่าย ส่งเสริมการเกิดอะไมด์ อิมีน หรือเบสชิฟฟ์ นอกจากนี้ยังใช้ในการสังเคราะห์ตัวยับยั้งเอนไซม์แบบ propargylamine เช่น monoamine oxidase (MAO) ซึ่งเกี่ยวข้องกับการรักษาโรคทางระบบประสาท เช่น โรคพาร์กินสันและอัลไซเมอร์ นอกจากนี้ยังเป็นสารตั้งต้นในการเตรียมโพรบเรืองแสงและโพลิเมอร์ที่ถูกปรับแต่งเนื่องจากคุณสมบัติการตอบสนองและโครงสร้าง