ใช้หลักly เป็นสารกลางในกระบวนการสังเคราะห์ยาและสารเคมีเกษตร หมู่ acid chloride ที่ทำปฏิกิริยาได้ง่ายช่วยให้สามารถสร้างพันธะ amide หรือ ester ซึ่งมีคุณค่าในการสร้างโมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ ใช้บ่อยในการพัฒนายาฆ่าเชื้อราและยาฆ่าหญ้า เนื่องจากวงแหวนไอโซซอกซาโซลมีความเสถียรและมีกิจกรรมทางชีวภาพ นอกจากนี้ยังใช้ในเคมียารักษาโรคเป็นส่วนประกอบพื้นฐานสำหรับตัวยับยั้ง kinase และยาต้านการอักเสบ โครงสร้าง phenyl และ heterocyclic ช่วยเพิ่มความสามารถในการจับเฉพาะในออกแบบยา ทำให้สามารถปรับปรุงคุณสมบัติเภสัชจลนศาสตร์ได้