ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์ยาและสารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โครงสร้างของมันทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในการพัฒนาสารยับยั้งคินาสและสารต้านจุลชีพ ใช้อย่างแพร่หลายในเคมียารักษาเพื่อสร้างยาที่มีฐาน quinoxaline โดยมุ่งเป้าไปที่มะเร็งและโรคติดเชื้อ นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยด้านเกษตรเคมีสำหรับออกแบบยาฆ่าแมลงใหม่ เนื่องจากมีปฏิกิริยาที่เหมาะสมและความเสถียรในกระบวนการแปลงสารอินทรีย์