ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์แบบแข็ง โดยเฉพาะในระบบ Fmoc (Fluoren-9-ylmethoxycarbonyl) ซึ่งหมู่ Fmoc จะทำหน้าที่ป้องกันหมู่อะมิโนในระหว่างการสร้างพันธะเปปไทด์ หลังจากนั้นสามารถถอดหมู่ป้องกันออกได้ง่ายด้วยเบสอ่อน เช่น แพนเพอรีน (piperidine) เพื่อให้สามารถเติมกรดอะมิโนตัวถัดไปได้ หมู่อะไซด์ (-N₃) ที่ตำแหน่ง C-6 ทำหน้าที่เป็นหมู่ฟังก์ชันที่สามารถเปลี่ยนแปลงได้ในขั้นตอนต่อไป เช่น ผ่านปฏิกิริยาคลิกเคมี (click chemistry) กับหมู่อัลไคน์ (alkyne) ภายใต้การเร่งปฏิกิริยาของทองแดง เพื่อสร้างโครงสร้างไตรอะโซล (triazole) ซึ่งมีประโยชน์ในการติดฉลากโมเลกุล หรือต่อเชื่อมเปปไทด์กับโปรตีน นาโนพาร์ติเคิล หรือสารเรืองแสง สำหรับการศึกษาในชีววิทยาหรือการพัฒนายา นิยมใช้ในงานวิจัยด้านชีวโมเลกุล เคมีเชิงชีวภาพ และการพัฒนายาเป้าหมายเฉพาะ (targeted drug delivery) โดยเฉพาะในการออกแบบเปปไทด์ที่มีการดัดแปลงพิเศษเพื่อเพิ่มความสามารถในการจับกับเป้าหมายหรือปรับปรุงเสถียรภาพ