ใช้เป็นตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะในกระบวนการผลิตเปปไทด์ที่มีโครงสร้างซับซ้อน ซึ่งหมู่ tert-butoxycarbonyl (Boc) และ allyloxy carbonyl (Alloc) ทำหน้าที่เป็นหมู่ป้องกันหมู่อะมิโน ช่วยควบคุมการเกิดปฏิกิริยาเฉพาะตำแหน่งที่ต้องการได้อย่างแม่นยำ เหมาะสำหรับการสร้างพันธะเปปไทด์แบบเลือกสรร โดยสามารถถอดหมู่ป้องกันออกได้ภายหลังภายใต้สภาวะที่แตกต่างกันโดยไม่กระทบต่อพันธะอื่นในโมเลกุล เหมาะสำหรับการใช้ในสังเคราะห์เปปไทด์เชิงซ้อน เช่น สารออกฤทธิ์ทางชีวภาพหรือยารักษาโรค