ใช้เป็นสารตั้งต้นแบบ chiral ในการสังเคราะห์เภสัชภัณฑ์ โดยเฉพาะในการพัฒนาส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) ที่ stereochemistry มีบทบาทสำคัญต่อกิจกรรมทางชีวภาพ วงแหวนเพอพิราซีนที่ป้องกันด้วย Boc ช่วยให้สามารถถอดการป้องกันแบบเลือกสรรและปรับแต่งเพิ่มเติม ทำให้มีคุณค่าในการสังเคราะห์อินทรีย์แบบหลายขั้นตอน ใช้บ่อยในการเตรียมยาตัวสมัครสำหรับโรคระบบประสาทส่วนกลาง โรคเมแทบอลิซึม และมะเร็ง เนื่องจากโครงสร้างเพอพิราซีนพบบ่อยในโมเลกุลชีวภาพที่มีกิจกรรม หมู่กรดคาร์บอกซิลช่วยในการจับคู่ปฏิกิริยากับเอมีนเพื่อสร้างพันธะอะไมด์ สนับสนุนการสร้างสถาปัตยกรรมโมเลกุลซับซ้อนในการวิจัยเคมียา