ใช้ในสังเคราะห์เปปไทด์แบบแข็ง โดยเฉพาะในกระบวนการผลิตเปปไทด์ที่ต้องการความบริสุทธิ์สูงและมีโครงสร้างเฉพาะตัว เนื่องจากหมู่ Fmoc ทำหน้าที่เป็นหมู่ป้องกันหมู่อะมิโน ซึ่งสามารถถอดออกได้ภายใต้สภาวะเบสอ่อน ทำให้เหมาะสมกับการสังเคราะห์แบบขั้นตอนเดียว (stepwise synthesis) นอกจากนี้ หมู่เพรอเพนิล (propynyl) ที่ตำแหน่งด้านข้างของกรดอะมิโนช่วยเพิ่มคุณสมบัติทางเคมีและชีวภาพ เช่น การทำปฏิกิริยาคลิกเคมี (click chemistry) ผ่านปฏิกิริยา Huisgen cycloaddition กับหมู่แอซีด ซึ่งนิยมใช้ในการติดฉลากเปปไทด์ หรือการเชื่อมต่อกับโมเลกุลอื่นเพื่อการศึกษาในงานวิจัยชีวโมเลกุลและการพัฒนายา