ใช้ในสังเคราะห์เปปไทด์แบบแข็ง โดยเฉพาะในกระบวนการผลิตเปปไทด์ที่ต้องการความบริสุทธิ์สูงและมีโครงสร้างเฉพาะตัว เนื่องจากหมู่ฟังก์ชัน FMOC ช่วยป้องกันไนโตรเจนของกรดอะมิโนในระหว่างการสังเคราะห์ ทำให้สามารถควบคุมลำดับของเปปไทด์ได้อย่างแม่นยำ นอกจากนี้ โครงสร้าง alpha-methyl ช่วยเพิ่มความเสถียรต่อการย่อยสลายของเปปไทด์ และช่วยปรับปรุงคุณสมบัติด้านชีวภาพ เช่น การดูดซึมและการจับกับเป้าหมายในระบบชีวภาพ นิยมใช้ในงานวิจัยด้านเภสัชกรรมและพัฒนายาใหม่ที่ต้องการความจำเพาะสูง