ใช้เป็นสารตั้งต้นคีย์ที่มีความชิรัลในการสังเคราะห์ยาเภสัชกรรม โดยเฉพาะในการพัฒนายับยั้งโปรติเอสและยาต้านไวรัส โครงสร้างไซโคลโพรพิลเอมีนแบบชิรัลช่วยให้เกิดการจับตัวเลือกเพศในระบบชีวภาพ ทำให้มีคุณค่าในการสร้างส่วนประกอบยาสำคัญที่บริสุทธิ์แบบเอ็นแอนติโอเมอร์ มักใช้ในการเตรียมยับยั้งโปรติเอส NS3/4A ของไวรัสตับอักเสบซี (HCV) เนื่องจากช่วยเพิ่มความเสถียรภาพทางเมแทบอลิซึมและปรับปรุงคุณสมบัติเภสัชจลนศาสตร์ นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยเคมียาเพื่อปรับปรุงยาที่เล็งเป้าไปยังความผิดปกติของระบบประสาทส่วนกลาง โดยกลุ่มอาริลฟลูออรีนช่วยในการทะลุทะลวงกำแพงเลือด-สมอง