สารนี้ถูกใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์เพปไทด์ โดยทำหน้าที่เป็นตัวกลางสำคัญสำหรับการนำกรดอะมิโนที่ป้องกันด้วย Fmoc พร้อมลิงเกอร์ที่ถูกฟังก์ชันนัไลซ์มาใช้ การประยุกต์ใช้หลักอยู่ในกระบวนการสังเคราะห์เพปไทด์แบบเฟสแข็ง (SPPS) ซึ่งช่วยให้สามารถยึดเพปไทด์กับตัวรองรับเรซินผ่านลิงเกอร์เอเทอร์ที่สามารถตัดขาดได้ กลุ่มกรดอะซิติกสามารถถูกกระตุ้นสำหรับการคัปปลิ้ง อนุญาตให้ประกอบเพปไทด์ทีละขั้นตอนในขณะที่รักษาความออร์โธกอนัลกับกลุ่มป้องกันอื่นๆ เนื่องจากกลุ่ม Fmoc จึงรองรับการถอดป้องกันด้วยเบสอ่อน ทำให้เข้ากันได้กับการป้องกันข้างโซ่ที่หลากหลาย มีคุณค่าอย่างยิ่งในการสังเคราะห์เพปไทด์ที่ซับซ้อนหรือถูกดัดแปลงที่ใช้ในการวิจัยและพัฒนายา