ใช้เป็นตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีโครงสร้างเปปไทด์หรือสารที่เกี่ยวข้องกับกรดอะมิโน โดยเฉพาะในกระบวนการผลิตยาที่ต้องการควบคุมความจำเพาะของสเตอริโอเคมี เนื่องจากหมู่ tert-butoxycarbonyl (Boc) ทำหน้าที่เป็นหมู่ป้องกันอะมิโน ซึ่งช่วยป้องกันไม่ให้เกิดปฏิกิริยาที่ไม่ต้องการในระหว่างการสังเคราะห์ หลังจากนั้นสามารถถอดหมู่ Boc ออกได้ง่ายภายใต้สภาวะกรดอ่อน ทำให้เหมาะสำหรับการสร้างโครงสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อน โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมยาและการวิจัยทางชีวเคมี