ใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์เปปไทด์และการพัฒนาสารประกอบชิรัล โดยสารนี้ทำหน้าที่เป็นตัวกลางสำคัญในการนำเข้าสารอนุพันธ์ทริปโตเฟนที่ได้รับการป้องกันพร้อมกับสเตอรีโอเคมีที่กำหนดไว้ กลุ่มฟลูออรีนิลเมทิลออกซิคาร์บอนิล (Fmoc) ช่วยให้เกิดการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสของแข็ง โดยการถอดการป้องกันแบบเลือกสรรภายใต้สภาวะเบสอ่อน ซึ่งช่วยรักษาความสมบูรณ์ของโซ่เปปไทด์ โครงสร้างโพลีไซคลิกที่แข็งช่วยสนับสนุนการก่อตัวของคอนฟอร์เมชันเฉพาะในเปปไทด์ชีวภาพ ทำให้มีคุณค่าต่อการวิจัยเภสัชกรรม โดยเฉพาะในการออกแบบยาที่มีฐานเป็นเปปไทด์สำหรับโรคทางระบบประสาทและเมแทบอลิซึม นอกจากนี้ ยังใช้ในการสังเคราะห์แบบอะซิมเมตริกและเคมียารักษาโรคสำหรับการสร้างโมเลกุลอินโดลที่ซับซ้อนที่มีความบริสุทธิ์ทางเอ็นแอนติโอเมอร์สูง โดยเฉพาะในเทคนิค Fmoc-solid phase peptide synthesis (Fmoc-SPPS) ซึ่งทำหน้าที่เป็นตัวป้องกันหมู่อะมิโน (amine protecting group) ที่เสถียรต่อเบสอ่อนแต่ถอดออกได้ง่ายด้วยเพอรีดีน ช่วยสร้างพันธะเปปไทด์อย่างมีประสิทธิภาพสำหรับเปปไทด์โครงสร้างซับซ้อนหรือยาว ยังเพิ่มความบริสุทธิ์และลดปฏิกิริยาข้างเคียง